Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GM2AP17900 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GM2AP17900 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GM2AP17900 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GM2AP17900 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms