Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms