Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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