Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PF4P02776 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PF4P02776 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PF4P02776 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PF4P02776 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PF4P02776 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PF4P02776 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PF4P02776 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PF4P02776 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PF4P02776 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PF4P02776 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PF4P02776 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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