Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms