Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC9O60706 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms