Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HHLA1C9JL84 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms