Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms