Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RAB18Q9NP72 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RAB18Q9NP72 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms