Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRA1Q9HD15 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRA1Q9HD15 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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