Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms