Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms