Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC93Q567U6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC93Q567U6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC93Q567U6 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC93Q567U6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms