Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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USP39Q53GS9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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USP39Q53GS9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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USP39Q53GS9 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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USP39Q53GS9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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USP39Q53GS9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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USP39Q53GS9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP39Q53GS9 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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