Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms