Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms