Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms