Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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