Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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