Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CUL4AQ13619 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CUL4AQ13619 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CUL4AQ13619 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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