Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRKAA1Q13131 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRKAA1Q13131 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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