Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms