Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms