Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms