Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms