Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASP9P55211 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASP9P55211 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASP9P55211 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASP9P55211 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASP9P55211 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASP9P55211 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASP9P55211 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASP9P55211 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASP9P55211 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASP9P55211 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CASP9P55211 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms