Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms