Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLMP48507 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLMP48507 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLMP48507 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLMP48507 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms