Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms