Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms