Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms