Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM10L1P0DMW3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM10L1P0DMW3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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