Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TNFRSF6BO95407 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TNFRSF6BO95407 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNFRSF6BO95407 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TNFRSF6BO95407 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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