Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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