Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms