Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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