Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHPF2Q9P2E5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms