Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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