Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms