Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3GQ9HC16 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms