Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHMP4AQ9BY43 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms