Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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