Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCMBPQ9BTE3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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