Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRACR2AQ9BSW2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms