Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms