Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms