Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms