Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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