Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SCGB2A2Q13296 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms