Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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